复旦大学附属中山医院厦门医院是厦门市政府和复旦大学合作建设的重大民生工程项目。医院选址在美丽的鹭岛厦门，坐落于五缘湾畔，占地面积6.22公顷，总建筑面积约17.5万平方米，编制床位800张，于2017年8月20日开张试运行、2018年1月8日全面开诊，是一所由复旦大学附属中山医院（简称“总部”）全面运营、同质化管理的首批国家重点建设的区域医疗中心、现代化综合性三级公立医院、厦门市医保定点医院。

医院依托总部18个国家临床重点专科,以心脏、肝脏、肾脏和肺部诊治疾病治疗为医院的重点和特色，目前已开放31个临床科室、9个医技科室，拥有樊嘉院士、葛均波院士等12个名医工作室。

医院实行临床“双主任”制，临床及医技辅助业务科室由总部各科室主任和资深专家担任，总部各学科主任定期赴厦进行手术、教学、查房、坐诊，医疗水平高，技术实力雄厚。