中心为全额事业单位，主要承担应急处理突发公共卫生事件，公共卫生检验监测，疾病预防控制，预防医学诊疗，健康咨询等职责。并承接“空气污染对人群健康影响监测”、“公共场所健康危害因素监测”、等多项国家监测项目。拥有“国家流感监测网络实验室”、“国家艾滋病确认实验室”等重点实验室，具备“公共场所卫生技术服务”等多项资质。